Penanganan hasil dan limbah ternak unggas meliputi pengelolaan kotoran, bangkai, dan limbah cair. Kotoran ayam dapat diolah menjadi pupuk kompos atau biogas. Bangkai ayam dapat dimanfaatkan sebagai pakan ikan atau dijadikan pupuk organik. Limbah cair dapat diolah melalui proses fisik, kimia, atau biologis untuk mengurangi pencemaran.